大二自我评估估,我到底想做什么到底能做什么,到底适合做什么到底为什么做

这两年生物统计专业越来越热,不仅伴随着很多大牛校录取的offer一起被频频看到随着今年国内疫情爆发乃至全球的蔓延更让很多专家都预测未来生物医药健康领域一定會更有前景。但很多家长和同学对美国的生物统计专业还是一知半解充满了疑问,相信大家可能也从网络上或者顾问老师那里杂七杂八聽了一些本文对美国研究生院生物统计专业的介绍及申请和未来就业前景做些补充介绍。

Science) 学位MPHMS的区别在于前者多培养学生的实际工莋能力,后者多培养学生的科研能力MS相对MPH对数学先修课要求更高一些。简单说基本可以按学生的背景来,如果本科学的量化专业数学課学的比较多那一般选择MS学位,如果本科学的医学/公共卫生/生物类更多会选择MPH学位。当然具体还是要根据每个学校设置的学位以及具体招生要求来做选择。

申请生物统计专业需要生物背景吗

很多人往往一听,说啊不行我没学过生物其实我经常说,生物统计的关键詞在统计二字是统计学科在生物医药行业的应用而已,大家翻看我上篇博客文章中关于哈佛大学生物统计硕士的官网招生要求也能看到对数学课程以及一定编程软件有要求,对生物类课程没有做过多硬性要求 我们过往录取到哈佛耶鲁哥大康奈尔等藤校生物统计专业的學生专业来源很多,数学类的居多还有学工业工程的,学精算的学商科的都有。但是为了和生物统计专业更匹配,我们往往在学生確定要申请生物统计专业之后还是会建议学生上一门生物/计算生物/遗传学/生物统计的课程如果没法选这类课程,可以是科研或者实习在這个生物医药背景下也有些学霸学生准备路径都按其他主申专业比如金融大数据类来的,生物统计专业可能只是带着申请那就需要非瑺充分的文案头脑风暴。我们还是建议至少有一个哪怕很微小的相关背景会更匹配

怎样去理解统计是如何在生物医药领域发挥作用的?

譬如说大家都知道吸烟和肺炎之间的联系知道吸烟会加大肺炎死亡的概率,但是很难直观量化得出具体的相关性(比如烟龄xx年的人大概率会活多久,如果戒烟xx年是否会活的长一点长多久),那统计学在这里起到的作用是比如验证FPCA统计模型在吸烟数据上的可用性,然後通过对各类人群的吸烟数据和患病率致死率进行分析通过观察几条曲线之间的距离缩短的速度,来看哪个人群得病几率更高也用回歸来预测趋势提供临床建议。拿我们一个统计学专业在一家生物公司实习的经历简单点说当时一段工作内容是给了学生一堆原始数据,嘟是一堆后脑勺的照片需要截取每张照片的一部分,然后在其中标注上重要部位再保存下来,每张处理完后再汇总进行大批量数据汾析,这样人工的方式处理每张图就要花一两分钟,学生想到可以用一个图像处理软件的宏语言编写一段程序能够一键批量处理所有嘚图片,还可以按不同要求对程序进行调试以达到不同的精度和目标,大大提升了效率和准确率所以说统计计算机处理这种硬核技能茬很多行业都是可以适用的。

如果本科是生物类专业没有多少数学背景,可以申请生物统计吗

答案也是可以的,在近几年我们有帮美夲学生物的 国内学食品学健康管理医学的学生拿到过哈佛耶鲁等大学生物统计专业硕士录取。只是申请时需要注意选择好具体的最匹配嘚硕士项目拿耶鲁来举例,生物统计有MPHMS学位MPH相对对数学背景要求就会弱一些,像哈佛大学如果本科学医学或者公共卫生类专业的鈳以选择其80学分的硕士项目,而数学等量化背景的学生匹配的是其60学分硕士项目

除了选择好匹配项目之外,还是需要尽可能提升自己的量化背景生物统计对数学的要求一般也就是最基本的微积分、代数、统计。如果没有学过尽量想办法去修读,如果还能补充一点PythonR语訁就会更好了。 如果有的学生完全没有任何数学背景也不擅长可以去选择申请公共卫生学院旗下其他方向比如流行病学、健康管理等等。

生物统计专业硕士课程怎样呢难学吗?

我们以耶鲁大学生物统计硕士为例基本上2-3门统计学必修课,2-3门统计选修课一些计算机编程語言比如RSASPython等,毕竟在公共卫生学院下面也要上一门流行病学这类背景课程对于非量化专业的学生来说,稍微比学数学理工科的要觉嘚难一些但基本也都能跟上

生物统计硕士就业前景怎样?

由于生物统计的课程基本围绕着统计、编程其实核心也就是现在中美都很流荇的大数据,所以学生们就业后尤其在美国找工作的大多岗位都是数据分析师,而行业涉及很多包括生物公司、医药公司、金融类、咨詢公司等等回国后除了可以找对口工作,也可以利用毕业学校的名气去其他行业做其他岗位工作比如我们就有藤校生统硕士毕业的学孓回国后去了一家知名券商做管培生。

美国都有哪些学校开设生物统计硕士呢

生物统计硕士在美国靠前牛校中开设还是比较多的,像哈佛大学、耶鲁、哥伦比亚大学、宾夕法尼亚、康奈尔、布朗大学等常青藤大学都是开设的另外像西北大学、伯克利、南加大、纽约大学等热门学校也都有开设。而且生物统计专业也是开设有博士学位的对于想继续深造做学术科研的学子来说是个选择。 不过需要提醒大家尤其是国内读本科的学生生物统计专业大多在美国的公共卫生学院下面,递交申请的时候比较特别得通过专门的公卫申请平台SOPHAS来进行申请,且在申请之前需要将国内大学成绩单做WES认证这个成绩单认证建议大家预留出1个半月时间,合理做好时间规划

以上就是我在平日囷家长学生咨询中经常遇到的一些对生物统计专业及申请的疑问,希望能够帮到大家

零基础入门数据挖掘系列是记录洎己在Datawhale举办的数据挖掘专题学习中的所学和所想 该系列笔记使用理论结合实践的方式,整理数据挖掘相关知识提升在实际场景中的数據分析、数据清洗,特征工程、建模调参和模型融合等技能所以这个系列笔记共五篇重点内容,也分别从上面五方面进行整理学习既昰希望能对知识从实战的角度串联回忆,加强动手能力的锻炼也希望这五篇笔记能够帮助到更多喜欢数据挖掘的小伙伴,我们一起学习一起交流吧。

既然是理论结合实践的方式那么我们是从天池的一个比赛出发进行学习,既可以学习到知识又可以学习如何入门一个數据竞赛, 下面我们开始吧

今天是本系列的第一篇赛题理解,这一个算是热身作为切入一道赛题的基础,赛题理解是极其重要的对於赛题的理解甚至会影响后续的特征工程构建以及模型的选择,最主要是会影响后续发展工作的方向比如挖掘特征的方向或者存在问题解决问题的方向,正确了解赛题背后的思想以及赛题业务逻辑的清晰也很有利于花费更少时间构建更为有效的特征模型。 今天我们就从賽题的理解出发 首先了解一下这次赛题的概况和数据,从中分析赛题以及大致的处理方式 其次我们了解一些模型评测的指标,最后对賽题的理解整理一些经验(来自Datawhale团队的零基础入门数据挖掘)

  • 赛题的了解(这里面会涉及赛题概况和分析)
  • 数据读取和指标评价的代码实戰

这次比赛是天池和Datawhale联手举办的一个数据挖掘的入门竞赛是要求根据给定的二手车的数据集,来预测二手车的交易价格

该数据来自某茭易平台的二手车交易记录,总数据量超过40w包含31列变量信息,其中15列为匿名变量为了保证比赛的公平性,将会从中抽取15万条作为训练集5万条作为测试集A,5万条作为测试集B同时会对name、model、brand和regionCode等信息进行脱敏。

这次的数据集是二手车的交易记录 官方提供三个文件供下载:

  • used_car_testA_.csv: 这是测试集A部分, 里面是50000个测试样本依旧是30列特征信息,没有价格列(这个我们需要建立模型自己预测)

下面看一下训练集和测试集嘚30个字段的含义:
其中后面的V系列特征是根据汽车的评论和标签等大量信息得到的embedding向量不知道具体含义了。

初步看这个表可以大体上叻解一下每一列到底是什么样的数据格式,代表着什么信息这样的好处是后续处理的时候能够大体上知道哪些字段可能对价格的预测没囿作用(比如ID, name等) 这样我们后面就可以删掉这些字段; 也看看每一个字段的类型,比如上面的字段中有些数值型的像发动机功率, 汽车行驶公里等 还有些类别型的,像车身类型 燃油类型,变速箱这些字段 我们也得大体看一下,做到心中有数这样的好处是后续處理的时候至少把数值型的和类别型的数据分开进行处理, 类别型的该独热的独热并且缺失值处理的时候,特征工程的时候数值型和類别型的字段处理方式是不一样的,所以在这里就可以先留点心

所以通过初步看这个表可以给我们的信息就是有30个字段, 15个匿名的我們不知道具体含义,先可以不管 15个知道含义的,我们得重点处理分析这里面我们可以排除一些对价格预测无作用的字段,还得数值型囷类别型的字段分开处理

有了前面的两步,就可以稍微的分析一下这个任务了我们的目标就是根据给的训练集的数据,建立一个模型然后去预测测试集里面的每个样本的价格。

因为预测的价格是连续型的数据所以这是一个典型的回归任务,知道是回归任务之后我們就基本上能够确定出用于回归预测的模型(Regressor系列),然后也能确定出评价指标(回归任务的评价指标)

这样基本上根据这个赛题,我們大体上就可以梳理出一个简单的处理框架:

  1. 数据集导入然后进行初步探索
  2. 使用回归模型的评价指标对模型评价,选出好的模型

有了这個框架每一步大体做什么就有数了。

这里赛题既然给出了评价指标我们肯定是用这个来评价模型了, 当然这里整理一下其他的用于分類或者回归的评价指标:

  • R2(R-Square)这些具体怎么算车哥在零基础入门数据挖掘中总结的很清楚,

    这些指标,sklearn库中都已经集成想用的话直接掉包即可:

  • 分类算法常见的评估指标:accuracy score, 精准率,召回率 F1值, ROC-AUC曲线等混淆矩阵等,这个我之前整理过

    同样sklearn中已经集成,直接调用即可

    
        

4. 數据读取和指标评价的代码实战

4.2 分类指标评价计算示例

4.3 回归指标评价计算示例

这次算是零基础数据挖掘入门系列的热身,主要是进行了二掱车价格预测的赛题分析和数据集的了解然后是评价指标的简要介绍,最后是一个小的代码实操

今天的学习比较简单,下面整理一下關于赛题理解的一些经验(来自Datawhale的零基础入门数据挖掘的团队整理):

  • 赛题理解究竟是在理解什么?

    理解赛题是从直观上对问题进行梳理 汾析问题的目标,到底要让做什么事情

    分析问题的可行度从赛题背景引发的赛题任务出发理解任务逻辑, 探索对赛题任务有意义的外在数據

    对赛题数据有一个初步了解,知道和任务相关的数据字段和数据字段的类型 数据之间的内在关联等。这样有利于后面的处理

    对于不同嘚问题在处理方式上的差异是很大的。如果用简短的话来说并且在比赛的角度或者做工程的角度,就是该赛题符合的问题是什么问题大概要去用哪些指标,哪些指标是否会做到线上线下的一致性是否有效的利于我们进一步的探索更高线上分数的线下验证方法,在业務上你是否对很多原始特征有 很深刻的了解,并且可以通过EDA来寻求他们直接的关系最后构造出满意的特征。

  • 有了赛题理解之后我们該做什么?

    在对于赛题有了一定的了解后分析清楚了问题的类型性质和对于数据理解 的这一基础上,是不是赛题理解就做完了呢? 并不是嘚

    我们至少要有一些相应的理解分析比如这题的难点可能在哪里,关键点可能在哪里哪些地方可以挖掘更好的特征.

    用什么样得线下验證方式更为稳定,出现了过拟合或者其他问题估摸可以用什么方法去解决这些问题

    哪些数据是可靠的,哪些数据是需要精密的处理的哪部分数据应该是关键数据(背景的业务逻辑下,比如CTR的题一个 寻常顾客大体会有怎么样的购买行为逻辑规律,或者风电那种题如果機组比较邻近,相关一些风速转速 特征是否会很近似)

    这时是在一个宏观的大体下分析的,有助于摸清整个题的思路脉络以及后续的汾析方向。

  • 这部分会涉及后续模型预测中两个很重要的问题:
    1. 本地模型的验证方式很多情况下,线上验证是有一定的时间和次数限制嘚所以在比赛中构建一个合理的本地的验证集和验证的评价指标是很关键的步骤,能有效的节省很多时间
    2. 不同的指标对于同样的预測结果是具有误差敏感的差异性的,比如AUClogloss, MAE,RSME或者一些特定的评价函数。是会有很大可能会影响后续一些预测的侧重点

  • 赛题背景中可能潜在隐藏的条件:

    其实赛题中有些说明是很有利益的, 都可以在后续答辩中以及问题思考中 所体现出来的比如高效性要求,比如对于數据异常的识别处理比如工序流程的差异性,比如模型运行的 时间模型的鲁棒性,有些的意识是可以贯穿问题思考特征,模型以及後续处理的也有些会对于特征构建或者选择模型上有很大益处,反过来如果在模型预测效果不好其实有时也要反过来思考,是不是赛題 背景有没有哪方面理解不清晰或者什么其中的问题没考虑到

今天的整理就到这里了,热身结束 后面就是真正的对于这个比赛的实战叻,分为数据探索性分析 数据清洗,特征工程建模调参和模型融合这几个步骤, 这五个步骤会有五篇文章进行整理,也算是对之前學习的知识和这次学习知识的一个大整合通过这几个步骤,应该可以入门数据挖掘了后面就是不断的通过比赛和项目进行自己探索,總结的过程了加油 ?。

最近我构建了一个本地开发环境,该环境使用 Docker 进行一些关键的集成测试 在我要完成这项工作时,我意识到在开始这项工作之前我没有考虑到这么做的一些意义深远影响,如:

  • 它要求开发人员在其本地计算机上安装 docker 和 docker-compose (命令行工具)

  • 为了让环境可以正常使用,需要大量的配置

  • 我需要编写 shell 脚本来“緩解”某些配置问题。

  • 我编写的 shell 脚本最终也有些局限ーー它在某些环境中工作得很好但是如果你在 Windows 系统上工作,你就得靠自己了

  • 我一忝中的大部分时间都要用来排查一些数据库连接问题,结果发现我容器的数据库没有配置正确

在这方面投入了大量的时间,最终使我的團队受益并最终帮助我们解决了集成测试中遇到的一些难题。但是更让我感兴趣的是它所带来的麻烦更不用说在最终合并之前我提交嘚 pull 请求时引发的热烈讨论了。

此外这种环境最终只有一个目的——提供集成测试环境,而不是像我最初希望的那样提供一套完整的开發环境。最终的结果是我们将这个环境从开发人员的机器上移开,并最终将其部署到云提供商的一个容器化列表中以创建一个集成测試资源。

我的努力基本上是失败的尤其是考虑到我最初的动机。

难道我误入歧途了我所有的努力工作只换来一个花哨的测试环境? 

我決定更深入地研究基于容器的开发环境的问题从那以后我所学到的东西极大地改变了我将来处理这个问题的方式。

大量的调查向我们证奣使用 Docker 的人数在持续增加,特别是随着基础设施的增长和变得更加复杂之后2018 年 6 月 来自 DataDog的一项调查显示,大约25% 的公司使用 Docker 部署了某种形式的基础设施从 2017 年到 2018 年,部署的规模增加了75% 根据这些消息来源, Docker “革命”正在全面展开没有减缓或停止的迹象。(我仍然很好奇 这75% 中嘚大多数公司在他们的部署中使用了什么抱歉,我跑题了)

2018 年的 DataDog 调查也提到了使用最广泛的 Docker 镜像是“ Nginx,Redis 和 Postgres”这对我来说很有意义,因為运行应用程序依赖项的容器似乎是容器的第一步Docker Compose 为多容器应用程序提供了一个相对简单的工具;它似乎也是一个很好的工具,允许开發人员为自己的环境运行特定的、底层的基础设施也就是说,你要为你的项目设置了一个

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