但战俘营问题在战争结束两年前变得严肃起来。因为Dix-Hill Cartel規定: 战俘交换释放后必须离开战斗队伍,还兵为民联邦军战俘释放后,大都回了北方老家;而战斗主要发生地在南方南方战俘被放後,有相当高的比例又重新投入战争事实上形成违约。于是北军逐渐单方面停止了协议的执行战俘营人员暴增。
食物严重不足医药渏缺,卫生恶劣到极点这些不必多说。很多战俘营只有围墙并无营房。南方战俘营里的战俘无力抵御暴晒(如安德森维尔战俘营);丠方无力抵御严寒(如埃尔米拉战俘营)死亡率高的有24%,大多都在15%以上
战俘营根本无法维持对日益增多的战俘的管理。战俘营的日常管理只能依靠战俘们自己主持。战俘内部的偷盗甚至谋杀由战俘们自行组织的执法队处理。
战争结束得很宁静只有一位负责管理南方军队关押北方战俘的战俘营的威尔兹上尉成了承担战争罪责的替罪羊。关于他是否有罪的争论持续了一百多年