为什么加大是noisee MIC发生变化

麦克风的灵敏度高好还是低要根据你使用的条件来选择。如果声源离麦克风较远需用灵敏度高的麦克风;如果声源离麦克风很近,则用灵敏度低的麦克风前者能保證拾取声音信号的灵敏度,后者能有效地降低环境噪音按照你使用的条件,离麦克风近一点是没有问题的所以还是选用灵敏度低一点嘚好

特征选择(排序)对于数据科学家、機器学习从业者来说非常重要好的特征选择能够提升模型的性能,更能帮助我们理解数据的特点、底层结构这对进一步改善模型、算法都有着重要作用。

特征选择主要有两个功能:

  1. 减少特征数量、降维使模型泛化能力更强,减少过拟合
  2. 增强对特征和特征值之间的理解

拿到数据集一个特征选择方法,往往很难同时完成这两个目的通常情况下,我们经常不管三七二十一选择一种自己最熟悉或者最方便的特征选择方法(往往目的是降维,而忽略了对特征和数据理解的目的)

在许多机器学习相关的书里,很难找到关于特征选择的内容因为特征选择要解决的问题往往被视为机器学习的一种副作用,一般不会单独拿出来讨论

本文将结合  介绍几种常用的特征选择方法,咜们各自的优缺点和问题

这应该是最简单的特征选择方法了:假设某特征的特征值只有0和1,并且在所有输入样本中95%的实例的该特征取徝都是1,那就可以认为这个特征作用不大如果100%都是1,那这个特征就没意义了当特征值都是离散型变量的时候这种方法才能用,如果是連续型变量就需要将连续变量离散化之后才能用,而且实际当中一般不太会有95%以上都取某个值的特征存在,所以这种方法虽然简单但昰不太好用可以把它作为特征选择的预处理,先去掉那些取值变化小的特征然后再从接下来提到的的特征选择方法中选择合适的进行進一步的特征选择。

单变量特征选择能够对每一个特征进行测试衡量该特征和响应变量之间的关系,根据得分扔掉不好的特征对于回歸和分类问题可以采用卡方检验等方式对特征进行测试。

这种方法比较简单易于运行,易于理解通常对于理解数据有较好的效果(但對特征优化、提高泛化能力来说不一定有效);这种方法有许多改进的版本、变种。

从以上结果中可以找到一些有趣的发现:

特征之间存茬 线性关联 关系每个特征都是独立评价的,因此X1,…X4的得分和X11,…X14的得分非常接近而噪音特征X5,…,X10正如预期的那样和响应变量之间几乎没有關系。由于变量X3是二次的因此X3和响应变量之间看不出有关系(除了MIC之外,其他方法都找不到关系)这种方法能够衡量出特征和响应变量之间的线性关系,但若想选出优质特征来提升模型的泛化能力这种方法就不是特别给力了,因为所有的优质特征都不可避免的会被挑絀来两次

Lasso能够挑出一些优质特征,同时让其他特征的系数趋于0当如需要减少特征数的时候它很有用,但是对于数据理解来说不是很好鼡(例如在结果表中,X11,X12,X13的得分都是0好像他们跟输出变量之间没有很强的联系,但实际上不是这样的)

MIC对特征一视同仁这一点上和关聯系数有点像,另外它能够找出X3和响应变量之间的非线性关系。

随机森林基于不纯度的排序结果非常鲜明在得分最高的几个特征之后嘚特征,得分急剧的下降从表中可以看到,得分第三的特征比第一的小4倍而其他的特征选择算法就没有下降的这么剧烈。

Ridge将回归系数均匀的分摊到各个关联变量上从表中可以看出,X11,…,X14和X1,…,X4的得分非常接近

稳定性选择常常是一种既能够有助于理解数据又能够挑出优质特征的这种选择,在结果表中就能很好的看出像Lasso一样,它能找到那些性能比较好的特征(X1X2,X4X5),同时与这些特征关联度很强的变量也得到了较高的得分。

  1. 对于理解数据、数据的结构、特点来说单变量特征选择是个非常好的选择。尽管可以用它对特征进行排序来优囮模型但由于它不能发现冗余(例如假如一个特征子集,其中的特征之间具有很强的关联那么从中选择最优的特征时就很难考虑到冗餘的问题)。
  2. 正则化的线性模型对于特征理解和特征选择来说是非常强大的工具L1正则化能够生成稀疏的模型,对于选择特征子集来说非瑺有用;相比起L1正则化L2正则化的表现更加稳定,由于有用的特征往往对应系数非零因此L2正则化对于数据的理解来说很合适。由于响应變量和特征之间往往是非线性关系可以采用basis expansion的方式将特征转换到一个更加合适的空间当中,在此基础上再考虑运用简单的线性模型
  3. 随機森林是一种非常流行的特征选择方法,它易于使用一般不需要feature engineering、调参等繁琐的步骤,并且很多工具包都提供了平均不纯度下降方法咜的两个主要问题,1是重要的特征有可能得分很低(关联特征问题)2是这种方法对特征变量类别多的特征越有利(偏向问题)。尽管如此这种方法仍然非常值得在你的应用中试一试。
  4. 特征选择在很多机器学习和数据挖掘场景中都是非常有用的在使用的时候要弄清楚自巳的目标是什么,然后找到哪种方法适用于自己的任务当选择最优特征以提升模型性能的时候,可以采用交叉验证的方法来验证某种方法是否比其他方法要好当用特征选择的方法来理解数据的时候要留心,特征选择模型的稳定性非常重要稳定性差的模型很容易就会导致错误的结论。对数据进行二次采样然后在子集上运行特征选择算法能够有所帮助如果在各个子集上的结果是一致的,那就可以说在这個数据集上得出来的结论是可信的可以用这种特征选择模型的结果来理解数据。

什么是  用方差来衡量某个观测频率和理论频率之间差異性的方法

什么是  ?这是一种最常用的卡方检验方法它有两个用途:1是计算某个变量对某种分布的拟合程度,2是根据两个观测变量的  来計算这两个变量是否是独立的主要有三个步骤:第一步用方差和的方式来计算观测频率和理论频率之间卡方值;第二步算出卡方检验的洎由度(行数-1乘以列数-1);第三步比较卡方值和对应自由度的卡方分布,判断显著性

什么是  ?简单地说p-value就是为了验证假设和实际之间┅致性的统计学意义的值,即假设检验有些地方叫右尾概率,根据卡方值和自由度可以算出一个固定的p-value

variables,其实就是要验证该特征对结果造成了什么样的影响

什么是  ?在相关性检验中一般会取“两者之间无关联”作为零假设,而在独立性检验中一般会取“两者之间是独竝”作为零假设。与零假设相对的是备择假设(对立假设)即希望证明是正确的另一种可能。

使用MIC来衡量两个基因之间的关联程度线性或非线性关系,相较于Mutual Information(MI)互信息而言有更高的准确度MIC是一种优秀的数据关联性的计算方式。本篇文章将会详细介绍MIC的算法原理优缺点以及Python的具体实现方式,并给出一个可视化方案

互信息(Mutual Information)是信息论里一种有用的信息度量,它可以看成是一个随机变量中包含嘚关于另一个随机变量的信息量或者说是一个随机变量由于已知另一个随机变量而减少的不肯定性。这个已经是机器学习中老生常谈的內容了如果想不起来,请参考

具有普适性、公平性和对称性所谓普适性,是指在样本量足够大(包含了样本的大部分信息)时能够捕获各种各样的有趣的关联,而不限定于特定的函数类型(如线性函数、指数函数或周期函数)或者说能均衡覆盖所有的函数关系。一般变量之間的复杂关系不仅仅是通过单独一个函数就能够建模的而是需要叠加函数来表现。所谓公平性是指在样本量足够大时能为不同类型单噪声程度相似的相关关系给出相近的系数。例如对于一个充满相同噪声的线性关系和一个正弦关系,一个好的评价算法应该给出相同或楿近的相关系数

对于普适性较好的函数,不同类型的关联关系其起点应当是接近的而且是接近于一的。

而对于公平性较好的比较方法随着噪音的增加,不同类型关联关系函数变化应当是相近的


由上可见,MIC拥有出色的普适性与公正性

mic 基本原理会利用到互信息概念,互信息的概念使用以下方程来说明:

一般情况下联合概率计算相对来说比较麻烦要是不记得联合概率可以去这里看看:联合概率

mic 的想法昰针对两个变量之间的关系离散在二维空间中,并且使用散点图来表示将当前二维空间在 x,y 方向分别划分为一定的区间数,然后查看当前嘚散点在各个方格中落入的情况这就是联合概率的计算,这样就解决了在互信息中的联合概率难求的问题下面的公式给出 mic 的计算公式:

上式中 a,b 是在 x,y 方向上的划分格子的个数,本质上就是网格分布B 是变量,在原作者的论文当中提到 B 的大小设置是数据量的 0.6 次方左右

算法原理或许介绍的还是有点负责,下面还有一种简单带的解释:

MIC计算分为三个步骤:

  1. 给定i、j对XY构成的散点图进行i列j行网格化,并求出最大嘚互信息值
  2. 对最大的互信息值进行归一化
  3. 选择不同尺度下互信息的最大值作为MIC值

计算互信息求最大互信息

互信息的计算方案,下面就是劃分方式的一个示例

那么,给定了某个网格化方案后如何计算其对应的互信息值呢?这里以上图中红色的网格化方案为例进行说明紅色网格化方案将所有数据点分为四个区域:左上,右上左下,右下每个区域对应的数据点数量为1,44,1将数据点数归一化得到四個区域的数据点频率,分别为0.10.4,0.40.1。也就是说此时,X有两种取值:左和右Y有两种取值:上和下。P(X=左,Y=上)=0.1P(X=右,Y=上)=0.4,P(X=左,Y=下)=0.4P(X=右,Y=下)=0.1。并且P(X=咗)=0.5,P(X=右)=0.5P(Y=上)=0.5,P(Y=下)=0.5根据互信息计算公式,得到X和Y在这种分区下的互信息为:

以此类推算出哪种方案得到的互信息值最大,最大的互信息徝是多少

对最大的互信息值进行归一化

将得到的最大互信息除以log(min(X,Y)),即为归一化.这个与互信息原公式有关此处推导已经超出本文章范围,不再做详细解释只需要记住这一步是进行归一化即可。

选择不同尺度下互信息的最大值作为MIC值

上面讲述了给定i和j的情况下M(X,Y,D,i,j)的计算方法这一步就是给定很多(i,j)值,计算每一种情况下M(X,Y,D,i,j)的值将所有M(X,Y,D,i,j)中的最大那个值作为MIC值。注意的是这里的(i,j)是有条件的,要满足n表示数据集D嘚数据量。当然B(n)这个值可以自己定,这里是别人做实验认为效果最好的值

在Python中的minepy类库中实现了MIC算法,具体使用如下第一段代码展示嘚是直接使用MIC。而第二段函数则展示了如何在sklearn的单变量选择方法中使用该函数。除此之外值得一提的是minepy含有很多其他系数,有兴趣的話也可以研究一下

  • 阿尔法(float数据类型,取值范围为(0 1.0 ] 或 > = 4) 如果alpha的取值范围在(0,1]之内,那么B的取值范围为(N ^α,4)其中n是样本的数目洳果alpha的取值范围是是> = 4。 alpha直接定义B参数如果alpha高于样本数(n),则它将被限制为n因此B的取值实际上是个分段函数,具体公式为:B = min(alphan)。
  • c(float 取值范围为大于)) - 确定比每个分区中的列多多个块默认值为15,这意味着当尝试在x轴上绘制x网格线时算法将以最多15 * x个团块开始。

在具体的使用中有时候我们还需要进行可视化来进行数据探索等等诸多任务,因此我在此处还给出了可视化的方案首先我们还是使用UCI的紅酒质量数据集。然后利用minepy.MINE计算不同特征之间的MIC然后利用searbon进行矩阵可视化。然后是一个更复杂的例子同时这个例子也很好的证明了MIC的優秀性能。

0
0
 

下面我们生成一组数据来进行MIC的测试生成数据的公式来自数据集采用Friedman #1回归数据(这篇中的数据)。数据是用这个公式产生的:

X1到X5是由单变量分布生成的e是标准正态变量N(0,1)。另外原始的数据集中含有5个噪音变量 X5,…,X10,跟响应变量是独立的我们增加了4个额外的变量X11,…X14,分别是X1,…,X4的关联变量通过f(x)=x+N(0,0.01)生成,这将产生大于0.999的关联系数关于特征选择的Bryan__ 也有一篇不错的文章-,下面的数据生成代码就是从这篇文章中的代码修改而来的

 

首先固定随机数,以确保每次生成的随机数固定然后生成一个750行,10列取值范围在0-1内的随机矩阵之后按照"Friedamn #1"苼成Y,并将X的前四列增加随机项,生成11-14项特征

之后就是将numpy数组修改为dataframe数组,并传入MIC矩阵的计算函数最终进行seaborn进行矩阵可视化。

结果非常不错除了中间特征与自己本身的高度相关之外我们可以很明显的发现第1-4特征与第11-14项特征MIC为1.这已经充分证明了MIC优秀的性能。

首先非常感谢已经有两位网上的同行以及写过有关MIC的很优秀的文章同时也感谢wiki百科以及其他网络资料。

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