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高质量DNA获取方法之月桂酸钠法
高质量DNA获取方法之月桂酸钠法
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从组织中获取DNA难吗?不难,真不难。高一就有开设的从鸡血中获取DNA的生物实验课,很简单的几步就可以得到DNA。但要想获取高质量的DNA,尤其是从一些富含多糖、多酚、淀粉、纤维和蛋白的组织,后面用于酶切、高通量测序大片段文库的构建,还是有一定的难度的。
最近协助北京农业生物技术研究中心一个老师提取桃叶片DNA还是遇到了一些困难,因为老师要做桃的个体重测序,因此对DNA的要求还是非常高的。之前跟其他很多老师交流植物DNA的提取,大多数目前仍然使用CTAB法,有些老师购买试剂盒进行提取,其实很多植物DNA提取试剂盒成分也是CTAB。CTAB法是提取植物DNA非常经典方法,但在提取的过程中由于要在65℃水浴中放置1个小时,因此耗时较长。我们在使用该法提取桃DNA时,获得DNA中含有大量的蛋白和多糖,虽然通过多次的苯酚氯仿抽提可以大部分去除,但DNA得率较低。在这里给大家分享一种快速获取植物高质量DNA的方法,供大家在提取植物DNA时作为参考,用该法提取的植物DNA完全满足后续酶切、BAC文库构建、高通量测序大片段文库构建,将该法称之为月桂酸钠法。
月桂酸钠抽提缓冲液: Tris-Hcl(pH8.0)100mmol/L;NaCl 100mmol/L;EDTA(pH8.0)20mmol/L;月桂酸钠 1%;
配法:准确称取NaCl 5.844g,月桂酸钠 10g置于1000mL烧杯中,加入100ml Tris-Hcl(1M)以及40mLEDTA(0.5M)、800mlddH2O,用盐酸调节pH至8.0,定容至1000 mL,灭菌后室温保存。
月桂酸钠英文名称:sodium lauroyl sarcosine
分子式:C15H28NaO3N,分子量:293.39。
以该法大量获取玉米叶片DNA为例的实验流程: (1)选取适量的玉米幼苗新鲜叶片,以纱布捆扎,做好标记,置于液氮中保存; (2)研钵以液氮预冷,将玉米叶片置于研钵中,倒入液氮,迅速研磨至粉末级,期间时时加入液氮,防止研磨过程中DNA被降解; (3)将研磨好的粉末移入灭菌后的50mL抽提试管中,用移液管加入10mL月桂酸钠抽提缓冲液,反复缓慢的摇匀; (4)用移液管向50mL抽提试管中加入等体积(10mL)酚:氯仿:异戊醇(25:24:1),反复缓慢的摇匀; (5)12000 rpm,4°C离心20min后取出,小心吸取上清液16mL于新灭菌的50ml抽提试管中; (6)向上述抽提试管中加入12mL异丙醇,上下缓慢颠倒数次,有白色絮状沉淀析出,颠倒时注意往一个方向,防止沉淀散开,不利于后续实验; (7)将白色絮状沉淀用枪头从抽提试管中轻轻挑出,至于2mL EP管中; (8)向上述2mL EP管中加入1.8mL70%乙醇,反复轻轻震荡洗涤,4°C,12000 rpm,高速离心15min,弃上清,重复此步骤两次; (9)将得到的白色沉淀再次4°C,12000 rpm短暂离心数秒,以移液器吸干残留乙醇; (10)白色沉淀置于37°C干燥箱中,使残存的70%乙醇全部挥发干净,这个过程中要经常拿出观察,防止过度烘干,不利于后面溶解; (11)待白色沉淀变透明后,向2mLEP管中加入0.9mLTE缓冲液(pH8.0),放置于65℃恒温箱中,期间轻微弹匀,使DNA充分溶解; (12)DNA完全溶解后,加入5μL RNase(0.1mg/mL),置于37°C干燥箱中30min,消化RNA,取出3μL,以1%琼脂糖胶检测是否有RNA残留; (13)待RNA消化完成后,向EP管中加入等体积(0.9mL)氯仿,轻轻摇匀; (14)4°C,12000 rpm高速离心15min; (15)吸取0.7mL上清置于1.5ml新EP管中,加入1/10体积(约0.07mL)NaAc(3M/L)溶液,轻轻摇匀; (16)向上述EP管中加入等体积(0.7mL)异丙醇,轻轻摇匀后,于-20°C静置20min; (17)4°C,12000 rpm高速离心15min,弃上清; (18)将得到的白色沉淀以70%乙醇洗涤两次,去除残留的乙醇; (19)白色沉淀置于37°C干燥箱中,使残存的70%乙醇全部挥发干净,该过程中要经常拿出观察,防止烘干过度,不利于后面溶解; (20)待白色沉淀变透明,管中无残留的乙醇味后,加入200μL TE(pH8.0),于37°C干燥箱中溶解; (21)待DNA完全溶解后,取出1μL,以分光光度计测定OD值,分装后于保存(-20°C)。 以该法获取的玉米叶片DNA电泳图如下:
DNA提取过程中常见问题及建议解决方案:
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DXY All Rights Reserved.我的月桂一个月前叶子开始变干了,怎么回事啊?
还有牡丹花一个礼拜之内,叶子也干枯,是不是得了什么病?
感谢能够帮我解答问题的朋友!!
用大生600倍液或敌力脱2500倍液或其他杀菌剂喷雾防治就可以了
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月桂女神的故事
月桂女神的故事  传说一:    当年与宙斯的大儿子阿波罗互相爱慕。终于,有一天阿波罗终于按捺不住自己对月桂女神的爱恋,对她展开的追求。    可是因为阿波罗自己是太阳神,身体聚集了大量的热能,使得月桂难以忍受。所以每次阿波罗追月桂,她就会躲。就这样,一追一躲,终于月桂无法忍受了,她大喊救命。    她的父亲河神林恩因不忍女儿遭受如此痛苦,就将大地劈裂了一条大缝。月桂纵身一跳,化成了一棵大树从裂缝中长出。    自此,这棵树就叫做月桂树。    而阿波罗并不知道缘由,认为月桂宁可变成大树也不愿和他在一起。直到有一天,他突然意识到原来是因为自己太热了才使得月桂化作一棵大树。阿波罗发誓要永远为月桂留下一片遮蔽。那就是我们现在知道的太阳黑子,在太阳神心中留下的永远的遮蔽,他为月桂留下的遮蔽。    传说故事二:    有一次,阿波罗看到小爱神丘比特正拿着弓箭玩。他毫不客气地警告丘比特说:“喂!弓箭是很危险的东西,小孩子不要随便拿来玩。”原来小爱神丘比特有两支十分特别的箭:凡是被他用那支黄金制成的利箭射到的人,心中会立刻燃起恋爱的热情;要是被另外一支铅做的钝箭射到的人,就会十分厌恶爱情。    丘比特被阿波罗这么一说,心里很不服气。他趁着阿波罗不注意的时候,“嗖”的一声把爱情之箭射向阿波罗,阿波罗心中立刻燃起了爱情的火焰。正巧这时,来了一名叫达夫妮的美丽少女。调皮的丘比特把那支铅制的钝箭射向达夫妮,被射中的达夫妮,立刻就变得十分厌恶爱情。    这时候被爱情之箭射中的阿波罗已经深深地爱上了达夫妮,于是他立刻对达夫妮表达自己的爱慕之情。    可是达夫妮却很不高兴的说:“走开!我讨厌爱情!离我远一点!”说着就像羚羊似的往山谷里飞奔而去。可是阿波罗对于追求达夫妮并不灰心,他拿着竖琴,弹奏出优美的曲子。不论谁听到阿波罗的琴声,都会情不自禁的走到他面前聆听他的演奏。躲在深山里的达夫妮也听到了这优美的琴声,也不知不觉地陶醉了。“哪儿来的这么动人的琴声?我要看看是谁在弹奏。”说着,达夫妮早已经被琴声迷住了,走向了阿波罗。躲在一块大石头后面弹着竖琴的阿波罗立刻跳了出来,走上前要拥抱达夫妮。达夫妮看到阿波罗,拔腿就跑。阿波罗在后面苦苦追赶,并且大声叫喊:“我又不是你的仇人,也不是凶猛的野兽,更不是无理取闹的莽汉,你为什么要躲着我呢?”尽管阿波罗在后面不停的对达夫妮呼喊,达夫妮仍然当作没听到,继续向前飞奔。不过达夫妮跑的再快,也跑不过阿波罗。跑了好一阵子,达夫妮已经跑的筋疲力尽,上气不接下气。    最后,她倒在地上,眼看着阿波罗就要追上了,达夫妮急得大叫:“救命啊!救命啊!”这时候,河神听见了达夫妮的求救声,立刻用神力把她变成了一颗月桂树。只见达夫妮的秀发变成了树叶,手腕变成了树枝,两条腿变成了树干,两只脚和脚趾变成了树根,深深地扎入了泥土中。阿波罗看到了懊悔万分,他很伤心的抱着月桂树哭泣,可是月桂树却不停的摇动。虽然达夫妮已经变成了月桂树,但是阿波罗依然爱着她。    阿波罗凝视着月桂树,痴情的说:“你虽然没能成为我的妻子,但是我会永远的爱着你。我要用你的枝叶做我的桂冠,用你的木材做我的竖琴,并用你的花装饰我的弓。同时我要赐你永远的年轻,不会衰老。”变成月桂树的达夫妮听了,深深地受到了感动,连连点头,表示谢意。    也许是受到了阿波罗的祝福,月桂树终年常绿,是一种深受人们喜爱的植物。
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